運行控制是金華ISO45001認證中最重要、用途最廣泛和最具實際工作內容的要素之一，是正常情況下控制重大危險源的主要途徑。這些運行控制程序包括：廠房、工藝流程和作業環境的安全設計，機械、起重、電器等設備的安全使用，危險及有毒有害作業控制，危險材料(易燃易爆有毒有害)的貯存與管理，安全防護設備、裝置、用品的供應、維護、控制等。
    金華ISO45001認證之還應注意對供方、合同方、承包方等相關方所提供的設備、材料、服務中存在的危險源通過制定管理程序來施加影響進行控制。與ISO14001標準相比，增加d）條款，體現安全管理控制范圍更為寬廣。